在公司章程中，股东决议程序的设定是保障公司治理合法合规的重要环节。科学合理的决议程序不仅能提高决策效率，还能有效避免因程序瑕疵引发的法律纠纷。

首先，明确决议事项的范围和权限。公司章程应规定哪些事项需要通过股东决议，如公司增资、减资、重大资产处置、董事任免等。通常情况下，这些事项应在股东大会或股东会中进行讨论和表决。

其次，规范决议的提议程序。任何股东或董事会成员提出决议事项时，应提前一定时间向公司管理层提交议案，并说明议案内容及必要性。公司管理层应对议案进行初步审核，并在召开股东大会之前将议案提前通知全体股东，确保股东有充足时间了解和准备。

再次，确定表决方式和表决比例。一般情况下，重大事项需要三分之二以上表决权通过，而普通事项则可以采用过半数表决权通过的方式。章程中应明确投票方式，如现场投票、电子投票或书面表决，确保投票程序合法有效。

此外，决议形成后需进行记录和存档。股东大会结束后，应当形成会议纪要，并由出席会议的董事和记录人签字确认。会议纪要应包括决议事项、表决结果及股东意见等，确保记录准确完整。

在实际操作中，由于章程约定不规范或表决程序不合法，往往导致股东决议无效或引发纠纷。因此，建议在制定公司章程时，严格按照法律规定和公司治理需求进行合理设计。

如遇公司章程设计或股东决议程序上的疑问或争议，建议及时寻求专业法律服务。天津和然律师事务所在公司治理和章程制定方面拥有丰富的经验，能够帮助企业合理规划股东决议程序，确保合法合规。